159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1038 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  100 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  67.21 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  50.62 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  48.54 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  40.91 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  38.31 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  42.29 
 
 		 300 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  42.42 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  40 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  37.83 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  38.53 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  38.53 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  37.16 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  38.18 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  35.78 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  36.55 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  38.84 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  38.84 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  40.43 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  33.21 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  38.05 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  36.82 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  38.6 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  35.61 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  35.69 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  35.57 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.55 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  39.38 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  39.38 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  39.38 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  37.04 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  38.94 
 
 		 312 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  39.73 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  36.03 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  38.68 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  35.1 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  32.91 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  32.32 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  34.29 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  33.19 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  37.01 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  33.94 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  32.23 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  36.65 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  31.69 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  35.32 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  37.84 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  37.31 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  37.8 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  36.82 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  33.91 
 
 		 305 aa  95.9  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  32.12 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  35.17 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  34.01 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  38.36 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  35.48 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  32.57 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  37.1 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  40.1 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  34 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  35.5 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  36.41 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  33.78 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  31.33 
 
 		 286 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  36.99 
 
 		 310 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  33.48 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  29.17 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  32.06 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  32.59 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  32.59 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  33.92 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  33.64 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  27.78 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  32.38 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  29.75 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  29.69 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  33.79 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  29.17 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  30.71 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  29.54 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  27.95 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  28.21 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  28.98 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  28.98 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  28.98 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  28.98 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  28.75 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  28.57 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  40 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  29.96 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  28.86 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>