More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04892 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  100 
 
 
134 aa  275  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  84.96 
 
 
135 aa  244  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
136 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  40.44 
 
 
134 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  40.74 
 
 
134 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  33.59 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
143 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  32.82 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  33.33 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  32.82 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  32.82 
 
 
143 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  32.82 
 
 
143 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  32.82 
 
 
143 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  32.82 
 
 
143 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  32.82 
 
 
143 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  32.82 
 
 
143 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  34.43 
 
 
134 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
132 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.8 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
163 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  35.2 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  30.4 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
213 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  34.15 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  34.15 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  34.15 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  34.15 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  34.15 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  34.15 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1853  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107665  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  32.23 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  27.27 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  33.59 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>