More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02348 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  100 
 
 
339 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  81.29 
 
 
356 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  63.64 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  62.06 
 
 
347 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  60.44 
 
 
321 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  58.99 
 
 
318 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  58.59 
 
 
333 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  59.32 
 
 
331 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  59.32 
 
 
331 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  61.32 
 
 
319 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  61.64 
 
 
319 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  62.7 
 
 
326 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  61.64 
 
 
319 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  62.38 
 
 
326 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  61.32 
 
 
319 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  61.32 
 
 
319 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  59.62 
 
 
318 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  61.13 
 
 
319 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  61.32 
 
 
319 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  60.25 
 
 
319 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  59.43 
 
 
318 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  58.04 
 
 
318 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  58.04 
 
 
318 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  60.38 
 
 
318 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  57.19 
 
 
318 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.04 
 
 
318 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  56.56 
 
 
318 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  58.04 
 
 
318 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  58.04 
 
 
318 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  58.62 
 
 
318 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  59.31 
 
 
335 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  58.04 
 
 
318 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  58.68 
 
 
316 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  55.87 
 
 
318 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  57.73 
 
 
318 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  57.73 
 
 
318 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  57.73 
 
 
318 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  61.44 
 
 
319 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  57.56 
 
 
318 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  57.23 
 
 
318 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  52.98 
 
 
323 aa  363  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  56.78 
 
 
318 aa  360  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  55.62 
 
 
319 aa  359  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.66 
 
 
325 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  54.86 
 
 
326 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  58.7 
 
 
324 aa  338  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  53.02 
 
 
325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  52.8 
 
 
321 aa  328  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  49.84 
 
 
332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  48.09 
 
 
320 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  50.32 
 
 
327 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  54.93 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  54.81 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  49.04 
 
 
327 aa  316  4e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  50.63 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  50.96 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.05 
 
 
342 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  47.99 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  50.64 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55 
 
 
318 aa  311  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.62 
 
 
329 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.8 
 
 
322 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  47.45 
 
 
315 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.92 
 
 
350 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.28 
 
 
329 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.01 
 
 
329 aa  308  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  48.48 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.55 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  47.15 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  47.27 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.94 
 
 
333 aa  302  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  48.71 
 
 
325 aa  302  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  48.18 
 
 
333 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  48.28 
 
 
332 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.55 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.53 
 
 
333 aa  301  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  49.2 
 
 
328 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  48.04 
 
 
333 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  50.81 
 
 
330 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.81 
 
 
330 aa  298  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  50.16 
 
 
345 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  45.12 
 
 
330 aa  298  9e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.55 
 
 
317 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  46.98 
 
 
334 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.28 
 
 
332 aa  294  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.69 
 
 
330 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 
327 aa  291  7e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.2 
 
 
332 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  51.77 
 
 
332 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  48.9 
 
 
324 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  48.25 
 
 
332 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  46.06 
 
 
328 aa  288  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 
325 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.66 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.59 
 
 
332 aa  286  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  44.27 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  48.51 
 
 
371 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  49.67 
 
 
345 aa  282  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>