51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3445 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 333 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  79.58 
 
 		 333 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  39.76 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.94 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.64 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2179  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209398  hitchhiker  0.000230453 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  25.82 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.21 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  26.02 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  24.67 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  23.9 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  22.75 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  24.82 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  30.19 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.56 
 
 		 754 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  23.91 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 722 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2193  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2066  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3085  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2548  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0714  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3145  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  33.8 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3122  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  22.78 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  28.69 
 
 		 574 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  28.69 
 
 		 575 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 282 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>