25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2967 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  71.83 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  35.92 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  26.72 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  32.73 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  30.7 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  24.43 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  30.7 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  30.7 
 
 		 191 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  31.82 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  25.64 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  29.73 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  41.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  33.77 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  24.31 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  30.19 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  31.96 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  26.15 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  30.83 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  34.58 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  27.94 
 
 		 154 aa  43.9  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  30.08 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  33.64 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  32.94 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  29.79 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>