More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0129 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  100 
 
 
267 aa  546  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  72.73 
 
 
275 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  73.51 
 
 
277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2114  IstB domain protein ATP-binding protein  74.06 
 
 
269 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  72.96 
 
 
273 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  72.96 
 
 
273 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  72.96 
 
 
273 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  72.96 
 
 
273 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  71.54 
 
 
265 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  71.54 
 
 
265 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  71.54 
 
 
265 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  67.42 
 
 
266 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  61.89 
 
 
277 aa  333  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  61.89 
 
 
277 aa  333  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  60.08 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  60.08 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  60.08 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  60.08 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  60.08 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  60.08 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  60.08 
 
 
265 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  57.63 
 
 
269 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  57.63 
 
 
269 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  65.8 
 
 
253 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  57.85 
 
 
261 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  57.85 
 
 
261 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  57.47 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  57.47 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  57.36 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  59.84 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  59.84 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  59.84 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  61.54 
 
 
261 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  61.54 
 
 
260 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0314  IstB domain protein ATP-binding protein  58.89 
 
 
256 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.198752  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1594  IstB domain protein ATP-binding protein  58.89 
 
 
256 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.366268  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0674  IstB domain protein ATP-binding protein  58.89 
 
 
256 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109995  hitchhiker  0.00130899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1721  IstB domain protein ATP-binding protein  58.89 
 
 
256 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1677  IstB domain protein ATP-binding protein  58.89 
 
 
256 aa  292  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3164  IstB ATP binding domain-containing protein  58.33 
 
 
260 aa  289  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  58.01 
 
 
264 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  58.01 
 
 
264 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  58.01 
 
 
264 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  58.01 
 
 
264 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  56.67 
 
 
245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0418  IstB-like ATP-binding protein  57.92 
 
 
255 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176117  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1250  IstB-like ATP-binding protein  57.92 
 
 
255 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2697  IstB ATP binding domain-containing protein  57.2 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.689881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1038  IstB domain protein ATP-binding protein  55.08 
 
 
287 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0319  IstB-like ATP-binding protein  54.66 
 
 
287 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  54.66 
 
 
287 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3913  IstB-like ATP-binding protein  54.66 
 
 
287 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3924  IstB-like ATP-binding protein  54.66 
 
 
287 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  53.59 
 
 
287 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  53.59 
 
 
287 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0788  IstB-like ATP-binding protein  54.24 
 
 
287 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.867709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0900  IstB-like ATP-binding protein  54.24 
 
 
287 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3715  IstB-like ATP-binding protein  54.24 
 
 
287 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  52.77 
 
 
247 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  52.3 
 
 
245 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  53.14 
 
 
242 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  53.14 
 
 
242 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  53.14 
 
 
242 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  53.14 
 
 
243 aa  250  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  53.97 
 
 
242 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  53.97 
 
 
242 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  50.63 
 
 
242 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  53.14 
 
 
243 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2497  ATPase  56.59 
 
 
217 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6518  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.105365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  51.88 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  51.88 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
242 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
242 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
242 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
242 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
242 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
242 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  50.63 
 
 
242 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3577  IstB domain protein ATP-binding protein  52.84 
 
 
242 aa  235  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1489  IstB domain protein ATP-binding protein  52.84 
 
 
242 aa  235  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2721  IstB ATP binding domain-containing protein  66.92 
 
 
140 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  42.21 
 
 
252 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  42.21 
 
 
252 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  42.21 
 
 
252 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  50.31 
 
 
250 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  47.06 
 
 
255 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>