24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0033 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  319  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  95.29 
 
 
170 aa  307  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  93.53 
 
 
170 aa  301  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  85.29 
 
 
170 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  73.19 
 
 
176 aa  190  8e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  69.86 
 
 
177 aa  183  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  54.12 
 
 
173 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  59.87 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  56.8 
 
 
170 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  56.21 
 
 
170 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  70.2 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  33.33 
 
 
349 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  32.2 
 
 
384 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  25.71 
 
 
383 aa  51.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  32.74 
 
 
397 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  27.33 
 
 
355 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  28.06 
 
 
162 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  26.76 
 
 
368 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  28.67 
 
 
358 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  27.01 
 
 
357 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  27.01 
 
 
357 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  27.55 
 
 
338 aa  44.3  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  30.88 
 
 
354 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>