16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36720 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  100 
 
 
555 aa  1156    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  40.04 
 
 
565 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  39.46 
 
 
593 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  37.02 
 
 
686 aa  360  5e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82683  vacuolar protein sorting associated protein  26.79 
 
 
614 aa  211  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758582  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  20.79 
 
 
620 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  22.82 
 
 
641 aa  95.1  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  25.06 
 
 
527 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  21.62 
 
 
588 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  24.94 
 
 
648 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  24.12 
 
 
764 aa  70.1  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  22.26 
 
 
687 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  23.21 
 
 
645 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01770  ATP binding protein, putative  21.45 
 
 
672 aa  58.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02418  Putative uncharacterized proteinVacuolar sorting protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X126]  21.19 
 
 
655 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234287  normal  0.0512937 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  23.79 
 
 
776 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>