27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13511 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  100 
 
 		 939 aa  1946    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  36.92 
 
 		 854 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  36.3 
 
 		 839 aa  506  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  47.01 
 
 		 829 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  37.21 
 
 		 812 aa  416  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  24.81 
 
 		 1063 aa  214  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  27.89 
 
 		 979 aa  211  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  27.89 
 
 		 971 aa  211  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  24.3 
 
 		 630 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  25.24 
 
 		 935 aa  191  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  26.88 
 
 		 450 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  24.95 
 
 		 1019 aa  164  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  22.51 
 
 		 1277 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  23.85 
 
 		 895 aa  134  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  23.45 
 
 		 622 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  22.74 
 
 		 981 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  22 
 
 		 934 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  23.18 
 
 		 932 aa  88.6  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  21.73 
 
 		 936 aa  56.2  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  20.32 
 
 		 766 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  20.94 
 
 		 755 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  21.2 
 
 		 736 aa  48.1  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  20.5 
 
 		 732 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73005  predicted protein  24.76 
 
 		 589 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.792014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  19.87 
 
 		 947 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  24.68 
 
 		 717 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  23.97 
 
 		 841 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>