26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45381 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  100 
 
 
451 aa  940    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
177 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 
187 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
169 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  27.57 
 
 
183 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
170 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
181 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
185 aa  54.3  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  25.75 
 
 
178 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  30 
 
 
177 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 
178 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  30 
 
 
177 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  30 
 
 
178 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
182 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
182 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
189 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  24.58 
 
 
178 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  25.75 
 
 
181 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.12 
 
 
184 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
185 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  27.54 
 
 
180 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
171 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
178 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.43 
 
 
459 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>