18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11956 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  100 
 
 		 588 aa  1212    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  25.89 
 
 		 776 aa  226  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  28.16 
 
 		 620 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  27.41 
 
 		 687 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35091  predicted protein  24.64 
 
 		 721 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  23.41 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  24.53 
 
 		 648 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  25.06 
 
 		 645 aa  108  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  23.19 
 
 		 764 aa  99.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  24.82 
 
 		 527 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  21.91 
 
 		 565 aa  97.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  22.82 
 
 		 686 aa  88.2  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  22.28 
 
 		 593 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  21.62 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02418  Putative uncharacterized proteinVacuolar sorting protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X126]  20.11 
 
 		 655 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234287  normal  0.0512937 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42975  predicted protein  18.62 
 
 		 689 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82683  vacuolar protein sorting associated protein  20.1 
 
 		 614 aa  47  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01770  ATP binding protein, putative  19.48 
 
 		 672 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>