26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1658 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  100 
 
 
371 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  31.02 
 
 
382 aa  193  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  33.54 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  30.72 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  30.72 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  30.72 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  30.72 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  30.72 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  28.41 
 
 
388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  28.79 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  28 
 
 
335 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  27.48 
 
 
345 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  27.48 
 
 
345 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  27.05 
 
 
344 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  30.4 
 
 
242 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  24.42 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  23.76 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  22.93 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  22.93 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  28.46 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  24.08 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  26.63 
 
 
301 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  21.47 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  23.37 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  25.31 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  23.59 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>