More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0583 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  89.61 
 
 		 154 aa  288  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  90.26 
 
 		 154 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  90.26 
 
 		 154 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  283  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  97.86 
 
 		 140 aa  281  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  280  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  90.67 
 
 		 150 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  87.66 
 
 		 154 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  87.66 
 
 		 154 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  88 
 
 		 150 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  88 
 
 		 150 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  87.33 
 
 		 150 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  88 
 
 		 150 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  87.33 
 
 		 150 aa  275  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  87.33 
 
 		 150 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  85.33 
 
 		 150 aa  272  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  90.71 
 
 		 140 aa  262  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  87.86 
 
 		 140 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  72.19 
 
 		 151 aa  228  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  70.86 
 
 		 151 aa  224  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  68.87 
 
 		 151 aa  221  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  67.55 
 
 		 151 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  60.93 
 
 		 153 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  59.87 
 
 		 152 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  54.37 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  54.72 
 
 		 165 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  57.62 
 
 		 165 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  48.24 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  168  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  168  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  53.95 
 
 		 153 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  49.01 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  47.68 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  45.58 
 
 		 151 aa  141  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  47.4 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  45.33 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  45.33 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  44.37 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  46.71 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  45.58 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  48.63 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  47.59 
 
 		 153 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  42.36 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  48.28 
 
 		 153 aa  134  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  42.07 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  44.81 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  42.07 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  47.02 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  43.37 
 
 		 176 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  41.46 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  44.81 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  44.67 
 
 		 151 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  44.68 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  45.33 
 
 		 152 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  46.85 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  43.15 
 
 		 152 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  42.47 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  43.61 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  43.54 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  42.95 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  39.62 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  43.97 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  38.62 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  43.48 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  41.96 
 
 		 151 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  35.54 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  42.76 
 
 		 142 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  40.94 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  40.94 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  40.94 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  43.05 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  40.94 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  40.94 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  40.94 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>