More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.08 
 
 
827 aa  777    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.95 
 
 
822 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.08 
 
 
846 aa  978    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
846 aa  1692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.68 
 
 
822 aa  782    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.05 
 
 
850 aa  1078    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.56 
 
 
812 aa  1133    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.15 
 
 
818 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
817 aa  819    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.79 
 
 
818 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.58 
 
 
815 aa  754    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.02 
 
 
819 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.32 
 
 
846 aa  977    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.16 
 
 
818 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.02 
 
 
819 aa  807    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.9 
 
 
827 aa  785    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.16 
 
 
818 aa  803    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.26 
 
 
815 aa  983    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.89 
 
 
786 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 
689 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.71 
 
 
779 aa  537  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.13 
 
 
685 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.77 
 
 
818 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.49 
 
 
767 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 
763 aa  528  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.15 
 
 
818 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 
862 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.58 
 
 
779 aa  523  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.26 
 
 
842 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.05 
 
 
681 aa  521  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 
772 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 
740 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.41 
 
 
683 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 
842 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 
772 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.22 
 
 
717 aa  515  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.52 
 
 
700 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.62 
 
 
829 aa  512  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.49 
 
 
686 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.54 
 
 
714 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.17 
 
 
680 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.76 
 
 
685 aa  507  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.62 
 
 
776 aa  506  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.61 
 
 
694 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.85 
 
 
908 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 
679 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 
773 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.05 
 
 
765 aa  502  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 
682 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 
787 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.62 
 
 
772 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.05 
 
 
778 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.69 
 
 
715 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.62 
 
 
904 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.69 
 
 
805 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.88 
 
 
702 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.22 
 
 
682 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 
692 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.71 
 
 
776 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.54 
 
 
832 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.54 
 
 
715 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.76 
 
 
678 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 
682 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 
682 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 
682 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 
682 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 
753 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 
704 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 
690 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 
682 aa  489  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 
682 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 
706 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.62 
 
 
904 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.5 
 
 
703 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.25 
 
 
781 aa  484  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 
685 aa  486  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.79 
 
 
706 aa  480  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.66 
 
 
683 aa  482  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.07 
 
 
678 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.8 
 
 
702 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.54 
 
 
682 aa  482  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 
691 aa  481  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 
682 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.49 
 
 
671 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  38.46 
 
 
700 aa  479  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 
777 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.62 
 
 
740 aa  479  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.02 
 
 
903 aa  478  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 
785 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.26 
 
 
707 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 
791 aa  475  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 
657 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.65 
 
 
859 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 
902 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 
902 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 
690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 
697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 
902 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.54 
 
 
681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 
902 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>