21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15281 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_15281  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1170    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15091  Type II secretory pathway, pseudopilin PulG  65.12 
 
 		 216 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0724154  normal  0.298233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  29.11 
 
 		 560 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3116  WD40 domain-containing protein  25.17 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1878  hypothetical protein  24.83 
 
 		 635 aa  67  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154844  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3117  WD40 domain-containing protein  30.59 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000028868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1719  hypothetical protein  28.1 
 
 		 644 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0944619  decreased coverage  0.0039153 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2262  hypothetical protein  26.29 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  27.64 
 
 		 174 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  26.89 
 
 		 982 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.82 
 
 		 172 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  27.17 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  28.23 
 
 		 190 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.23 
 
 		 190 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.24 
 
 		 175 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  34.43 
 
 		 567 aa  44.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.17 
 
 		 590 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  44.3  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  32.39 
 
 		 188 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  36.21 
 
 		 527 aa  43.9  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.37 
 
 		 1028 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>