19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3897 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1753    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  46.25 
 
 		 882 aa  542  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1839  signal peptide and transmembrane prediction  43.28 
 
 		 648 aa  496  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2986  hypothetical protein  39.54 
 
 		 1042 aa  425  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.587543  hitchhiker  0.000328281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  38.91 
 
 		 823 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35518  predicted protein  35.48 
 
 		 982 aa  347  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1919  hypothetical protein  49.6 
 
 		 872 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45740  predicted protein  28.83 
 
 		 825 aa  217  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  42.69 
 
 		 1216 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0557  hypothetical protein  31.84 
 
 		 295 aa  104  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  42.98 
 
 		 1656 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  32.8 
 
 		 1342 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48710  predicted protein  24.33 
 
 		 969 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.873734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2142  hypothetical protein  23.33 
 
 		 528 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  20.76 
 
 		 536 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.6 
 
 		 1146 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 865 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  27.47 
 
 		 1053 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0403  hypothetical protein  24.5 
 
 		 222 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>