16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2277 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1093    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2142  hypothetical protein  49.11 
 
 
528 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.222842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3164  hypothetical protein  45.21 
 
 
534 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62222  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4748  hypothetical protein  45.9 
 
 
506 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4665  hypothetical protein  44.92 
 
 
506 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0433  hypothetical protein  44.69 
 
 
569 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0403  hypothetical protein  55.08 
 
 
222 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  31.2 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  33.78 
 
 
528 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0833  hypothetical protein  23.65 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.488386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2739  hypothetical protein  23.49 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.731986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0134  hypothetical protein  32.88 
 
 
622 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0479641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  20.76 
 
 
859 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  29.73 
 
 
14609 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0974  hypothetical protein  29.25 
 
 
660 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.518342  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  34.04 
 
 
882 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>