10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2986 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2986  hypothetical protein  100 
 
 		 1042 aa  2157    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.587543  hitchhiker  0.000328281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  39.54 
 
 		 859 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1839  signal peptide and transmembrane prediction  35.89 
 
 		 648 aa  353  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  34.55 
 
 		 882 aa  328  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  34.69 
 
 		 823 aa  289  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35518  predicted protein  29.74 
 
 		 982 aa  220  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45740  predicted protein  23.85 
 
 		 825 aa  131  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  22.66 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  42.11 
 
 		 928 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  34.48 
 
 		 268 aa  49.3  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>