37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0774 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  7e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  40.54 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0099  hypothetical protein  34.9 
 
 
148 aa  77.4  6e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0101  hypothetical protein  34.9 
 
 
148 aa  77.4  6e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  67  9e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2120  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  65.9  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0432407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  34.75 
 
 
161 aa  63.9  8e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  34.75 
 
 
161 aa  62.8  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  34.75 
 
 
161 aa  63.5  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 
159 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  32.21 
 
 
161 aa  62  3e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  32.21 
 
 
161 aa  62  3e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  32.67 
 
 
154 aa  60.8  6e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  60.5  8e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.06 
 
 
226 aa  50.4  9e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  50.4  9e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  27.92 
 
 
167 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 
226 aa  47  9e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  28.23 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  24.24 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  31.96 
 
 
230 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  21.77 
 
 
181 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  34.94 
 
 
228 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.93 
 
 
227 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  23.74 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
233 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 
193 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 
230 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.49 
 
 
230 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  35.63 
 
 
227 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  21.43 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
208 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  21.43 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  23.02 
 
 
187 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  21.58 
 
 
181 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>