More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37953 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  100 
 
 
497 aa  1031    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
487 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
485 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
493 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
493 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
465 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
455 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
481 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
456 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
494 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
460 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
485 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
485 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  47.19 
 
 
485 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
485 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
485 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
490 aa  428  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
488 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
454 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
468 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
480 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
461 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
483 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
480 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
459 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
456 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
459 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
488 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
461 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
461 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
505 aa  422  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
461 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
459 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
479 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
459 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
482 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
454 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
466 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
466 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
468 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
464 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
481 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
485 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
473 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
465 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
461 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
459 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
460 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
456 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
466 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1983  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
465 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746601  normal  0.57879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
461 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
465 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
465 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
459 aa  405  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2113  cysteinyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
465 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
459 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
465 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
465 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
460 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
473 aa  402  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
459 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
459 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
460 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
463 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
465 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
460 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1203  cysteinyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
465 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0892832  normal  0.183053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
466 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
462 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
465 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
465 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
463 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
460 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
465 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
465 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>