More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16290 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  100 
 
 
123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 
120 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  52.68 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  50.41 
 
 
122 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  48.31 
 
 
120 aa  120  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  50.44 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  50.44 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  47.01 
 
 
124 aa  116  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  47.11 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  42.5 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  48.76 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  49.56 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  47.37 
 
 
119 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  47.79 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  47.79 
 
 
120 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  44.25 
 
 
122 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  47.37 
 
 
122 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  44.25 
 
 
122 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  43.33 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  44.44 
 
 
122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  47.79 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  44.07 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  44.35 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  46.67 
 
 
118 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  45.76 
 
 
118 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  46.02 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  46.28 
 
 
124 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  45 
 
 
117 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  46.49 
 
 
119 aa  110  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  44.25 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  44.92 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  44.92 
 
 
118 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  46.85 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  45.13 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  48.7 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  47.37 
 
 
116 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 
120 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  47.11 
 
 
119 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  46.28 
 
 
117 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  45 
 
 
123 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  43.59 
 
 
118 aa  106  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 
119 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 
119 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  43.86 
 
 
121 aa  105  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
122 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  45.08 
 
 
120 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  44.44 
 
 
122 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  44.92 
 
 
119 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  45.1 
 
 
122 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  43.1 
 
 
125 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  46.15 
 
 
122 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 
121 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  40.83 
 
 
122 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  44.44 
 
 
122 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  44.17 
 
 
127 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  45.08 
 
 
116 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  46.22 
 
 
124 aa  104  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  45 
 
 
119 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  48.11 
 
 
122 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  46.15 
 
 
120 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  40.65 
 
 
122 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  42.06 
 
 
121 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  41.8 
 
 
121 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  45.69 
 
 
124 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  42.61 
 
 
121 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  41.67 
 
 
128 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
121 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  43.7 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  41.23 
 
 
122 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  41.53 
 
 
122 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  45.76 
 
 
119 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  41.18 
 
 
120 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  44.26 
 
 
116 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  44.26 
 
 
116 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 
119 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  45 
 
 
123 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  45.45 
 
 
134 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  46.6 
 
 
122 aa  100  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  41.13 
 
 
120 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  42.62 
 
 
117 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  43.48 
 
 
114 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  42.37 
 
 
124 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>