More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3183 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  55.24 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  53.65 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  53.64 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  52.83 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  52.83 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  50.31 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  52.52 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  52.35 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  52.41 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  49.24 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  46.54 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  43.89 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  43.23 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  42.36 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  45.08 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  44.94 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  43.67 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  39.94 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  33.76 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  40.21 
 
 		 313 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  40.44 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  37.81 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  39.6 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  39.18 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  38.01 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  40.34 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  40 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  39.01 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  32.26 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  34.24 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  34.24 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  34.24 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  34.24 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.9 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  37.86 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.98 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  39.55 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  31.7 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  32.11 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  40 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  32.44 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  36.91 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.91 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.54 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  38.68 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  38.75 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  30.82 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  32.25 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  40.58 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.08 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  36.92 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  30.67 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  35.55 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.34 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.93 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  34.4 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  34.4 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  34.4 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  34.4 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  34.4 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.77 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  34.4 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  34.4 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  35.46 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.48 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  29.83 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  30.82 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  34 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  34 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>