More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2932 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  50 
 
 
189 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  50 
 
 
189 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  45.33 
 
 
79 aa  80.5  8e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  42.47 
 
 
75 aa  79.7  1e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  49.33 
 
 
201 aa  79.7  1e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  41.1 
 
 
75 aa  78.6  3e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  44.12 
 
 
75 aa  78.2  4e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  47.37 
 
 
80 aa  77.8  5e-14  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  36.84 
 
 
78 aa  75.9  2e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  6.89982e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
186 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  41.89 
 
 
75 aa  75.1  3e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  41.56 
 
 
186 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.26035e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  41.56 
 
 
186 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
186 aa  74.3  5e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
186 aa  74.3  5e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  41.56 
 
 
186 aa  74.3  5e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  41.89 
 
 
76 aa  74.3  5e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  45.33 
 
 
80 aa  73.9  6e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  45.33 
 
 
80 aa  73.9  6e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  40.26 
 
 
186 aa  73.9  7e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47313e-12 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  40.26 
 
 
186 aa  73.9  7e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  40.54 
 
 
75 aa  73.2  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.96514e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  72.4  2e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  40.54 
 
 
75 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  36.36 
 
 
194 aa  72  2e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  42.86 
 
 
81 aa  72.4  2e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  43.48 
 
 
72 aa  72  2e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.26 
 
 
77 aa  71.6  3e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  41.89 
 
 
76 aa  71.6  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17975e-07 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  48.05 
 
 
81 aa  71.2  4e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  44.12 
 
 
75 aa  71.2  4e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  40.26 
 
 
186 aa  71.2  4e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.93639e-08 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  47.37 
 
 
81 aa  70.9  5e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  47.83 
 
 
77 aa  70.9  6e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  70.9  6e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  70.9  6e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  38.16 
 
 
77 aa  70.5  7e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.65 
 
 
75 aa  70.1  9e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  70.1  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3042e-14 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  70.1  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  41.43 
 
 
75 aa  70.1  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.69274e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  70.1  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  38.16 
 
 
77 aa  69.7  1e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  48.65 
 
 
84 aa  69.7  1e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  70.1  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  41.56 
 
 
78 aa  68.9  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  38.03 
 
 
78 aa  68.9  2e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  7.71633e-05  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  39.47 
 
 
77 aa  69.3  2e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  42.03 
 
 
83 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  39.44 
 
 
78 aa  68.9  2e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  42.65 
 
 
75 aa  68.6  2e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  3e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  68.2  3e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  6.71264e-06  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  38.36 
 
 
75 aa  68.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  42.03 
 
 
83 aa  68.6  3e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  3e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  42.65 
 
 
83 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  40.26 
 
 
81 aa  68.2  4e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  39.47 
 
 
79 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  67.8  5e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  44.12 
 
 
83 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69267e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  39.47 
 
 
79 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  67.8  5e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.24 
 
 
81 aa  67.4  7e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  43.48 
 
 
79 aa  67  8e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  42.65 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 
80 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  42.67 
 
 
80 aa  65.5  2e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  66.2  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  65.1  3e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  43.06 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  65.1  3e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  7.89219e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  39.71 
 
 
81 aa  65.1  3e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
80 aa  65.1  3e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
80 aa  65.1  3e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
80 aa  65.1  3e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  39.47 
 
 
77 aa  64.7  4e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  43.48 
 
 
79 aa  64.7  4e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  39.13 
 
 
81 aa  64.3  5e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  64.7  5e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  40.58 
 
 
84 aa  64.3  5e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  37.33 
 
 
76 aa  64.3  5e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.19157e-05  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  36.62 
 
 
83 aa  64.3  6e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  40.28 
 
 
92 aa  64.3  6e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  36.76 
 
 
81 aa  63.9  6e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  38.24 
 
 
76 aa  64.3  6e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  63.9  7e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  44.44 
 
 
82 aa  63.9  7e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  40.28 
 
 
76 aa  63.5  8e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  63.9  8e-10  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  37.68 
 
 
82 aa  63.5  9e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  39.13 
 
 
80 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
83 aa  62.8  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  39.13 
 
 
81 aa  62.8  1e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>