34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1708 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  53.49 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  50.41 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  46.09 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  37.29 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  32.17 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  37.01 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  38.18 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  36.27 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  35.85 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  32.43 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  31.97 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  33.98 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  29.51 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  32.5 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  31.82 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  33.98 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  36.19 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>