135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2718 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  100 
 
 
371 aa  763    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  52.73 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  51.59 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.103806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3515  HAD family hydrolase  46.24 
 
 
277 aa  258  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1795  HAD family hydrolase  45.96 
 
 
276 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000232683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2291  HAD family hydrolase  40.82 
 
 
264 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0714407  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  31.14 
 
 
729 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  30.51 
 
 
249 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  31.44 
 
 
725 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  30.34 
 
 
723 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  29.96 
 
 
714 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  29.96 
 
 
714 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  31.29 
 
 
252 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  30.37 
 
 
249 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
720 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  28.84 
 
 
722 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3120  glucosylglycerol-phosphate synthase  27.3 
 
 
752 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361992  normal  0.0244373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34680  glucosylglycerol-phosphate synthase  28.57 
 
 
750 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.966141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2470  sucrose phosphatase  29.56 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.34 
 
 
762 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  28.35 
 
 
735 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  29.21 
 
 
721 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
709 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
698 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2009  hypothetical protein  50.7 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000361388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2398  hypothetical protein  50.7 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00129219  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2120  hypothetical protein  50.7 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3831  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  27.64 
 
 
259 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678629  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1623  putative sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  27.59 
 
 
247 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0026077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.14 
 
 
688 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0203  protein of unknown function DUF709  44 
 
 
82 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.947238  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28910  predicted protein  24.82 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0458788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1998  protein of unknown function DUF709  49.3 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000810525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  25.94 
 
 
716 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  28.15 
 
 
684 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2755  hypothetical protein  47.89 
 
 
90 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  hitchhiker  0.0000961265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1665  hypothetical protein  49.3 
 
 
108 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000283207  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2802  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1504  hypothetical protein  49.3 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2005  protein of unknown function DUF709  47.89 
 
 
97 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.420178  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1953  hypothetical protein  49.3 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.192868  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2012  hypothetical protein  49.3 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.159587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1955  protein YcgL  49.3 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00440976  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2469  protein of unknown function DUF709  49.3 
 
 
97 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00179552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.21 
 
 
684 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1320  protein YcgL  49.3 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1970  hypothetical protein  49.3 
 
 
97 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000354905  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2370  hypothetical protein  46.48 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000770648  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01154  hypothetical protein  47.89 
 
 
108 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0106801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2237  protein of unknown function DUF709  46.48 
 
 
85 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1630  hypothetical protein  45.07 
 
 
95 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00174664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1941  hypothetical protein  46.48 
 
 
85 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01164  hypothetical protein  47.89 
 
 
108 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1279  hypothetical protein  47.89 
 
 
97 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000635197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1323  hypothetical protein  47.89 
 
 
97 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2446  hypothetical protein  47.89 
 
 
97 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294082  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1334  hypothetical protein  47.89 
 
 
97 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0109557  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  29.04 
 
 
709 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2183  hypothetical protein  49.3 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000467377  unclonable  0.00000159603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2443  hypothetical protein  42.25 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000239167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1544  hypothetical protein  47.89 
 
 
102 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000390367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2115  hypothetical protein  46.48 
 
 
93 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113125  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  28.3 
 
 
707 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3126  protein of unknown function DUF709  37.33 
 
 
81 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.679303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2518  hypothetical protein  45.07 
 
 
93 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0805  hypothetical protein  38.67 
 
 
92 aa  63.5  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.594534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  24.55 
 
 
718 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1929  hypothetical protein  43.66 
 
 
92 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000893078  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1869  hypothetical protein  34.12 
 
 
105 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000143556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1903  hypothetical protein  34.12 
 
 
105 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00038231  normal  0.870775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2381  hypothetical protein  40.85 
 
 
92 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000571137  normal  0.19582 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1068  hypothetical protein  43.66 
 
 
93 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2172  hypothetical protein  39.44 
 
 
92 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119171  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2249  hypothetical protein  39.44 
 
 
92 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000322271  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1076  hypothetical protein  35.21 
 
 
98 aa  59.7  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000579005  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2575  hypothetical protein  39.44 
 
 
92 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3921  hypothetical protein  42.67 
 
 
97 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004085  protein YcgL  42.25 
 
 
93 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000171174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2423  protein of unknown function DUF709  35.21 
 
 
92 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000116329  hitchhiker  0.00842429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1896  hypothetical protein  35.21 
 
 
92 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000145586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3517  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3906  protein of unknown function DUF709  40.58 
 
 
86 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1564  hypothetical protein  41.33 
 
 
97 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32960  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1738  hypothetical protein  40.85 
 
 
92 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01387  hypothetical protein  40.85 
 
 
93 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02884  hypothetical protein  36.23 
 
 
122 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01139  hypothetical protein  36 
 
 
98 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.118354  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  27.21 
 
 
708 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1766  hypothetical protein  35.21 
 
 
92 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47450  hypothetical protein  36 
 
 
97 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4096  hypothetical protein  36 
 
 
97 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1774  hypothetical protein  38.67 
 
 
97 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0857455  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  25.35 
 
 
724 aa  56.2  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4590  hypothetical protein  38.67 
 
 
97 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4120  hypothetical protein  38.67 
 
 
97 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  28.02 
 
 
707 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1298  hypothetical protein  38.67 
 
 
97 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  27.03 
 
 
702 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1389  hypothetical protein  38.67 
 
 
97 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>