73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1953 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1953  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.192868  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1955  protein YcgL  99.31 
 
 
144 aa  293  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00440976  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2012  hypothetical protein  99.31 
 
 
144 aa  293  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.159587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1504  hypothetical protein  99.31 
 
 
144 aa  293  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1320  protein YcgL  100 
 
 
136 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1665  hypothetical protein  84.47 
 
 
108 aa  186  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000283207  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01154  hypothetical protein  83.5 
 
 
108 aa  183  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0106801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01164  hypothetical protein  83.5 
 
 
108 aa  183  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2469  protein of unknown function DUF709  86.6 
 
 
97 aa  180  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00179552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1970  hypothetical protein  86.6 
 
 
97 aa  180  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000354905  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1334  hypothetical protein  85.57 
 
 
97 aa  177  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0109557  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2446  hypothetical protein  85.57 
 
 
97 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294082  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1323  hypothetical protein  85.57 
 
 
97 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1279  hypothetical protein  85.57 
 
 
97 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000635197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2370  hypothetical protein  83.67 
 
 
127 aa  176  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000770648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2755  hypothetical protein  75.86 
 
 
90 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  hitchhiker  0.0000961265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2005  protein of unknown function DUF709  71.74 
 
 
97 aa  140  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.420178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1941  hypothetical protein  81.48 
 
 
85 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1998  protein of unknown function DUF709  73.86 
 
 
90 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000810525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2237  protein of unknown function DUF709  81.48 
 
 
85 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2120  hypothetical protein  67.05 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2398  hypothetical protein  67.05 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00129219  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2009  hypothetical protein  67.05 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000361388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3517  hypothetical protein  56.18 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2183  hypothetical protein  53.93 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000467377  unclonable  0.00000159603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2443  hypothetical protein  51.65 
 
 
93 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000239167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1630  hypothetical protein  55.06 
 
 
95 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00174664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1929  hypothetical protein  52.81 
 
 
92 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000893078  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2518  hypothetical protein  53.93 
 
 
93 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2115  hypothetical protein  50.56 
 
 
93 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113125  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2802  hypothetical protein  48.86 
 
 
95 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004085  protein YcgL  50 
 
 
93 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000171174  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1068  hypothetical protein  54.76 
 
 
93 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1544  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000390367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1766  hypothetical protein  48.31 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2381  hypothetical protein  48.31 
 
 
92 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000571137  normal  0.19582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2172  hypothetical protein  48.31 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119171  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2249  hypothetical protein  48.31 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000322271  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01387  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2575  hypothetical protein  47.19 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1738  hypothetical protein  53.57 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1076  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000579005  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2423  protein of unknown function DUF709  46.07 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000116329  hitchhiker  0.00842429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1903  hypothetical protein  46.07 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00038231  normal  0.870775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1896  hypothetical protein  46.07 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000145586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1869  hypothetical protein  46.07 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000143556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01139  hypothetical protein  44.94 
 
 
98 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.118354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0805  hypothetical protein  39.56 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.594534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32960  hypothetical protein  46.34 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1339  hypothetical protein  44.58 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1774  hypothetical protein  44.05 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0857455  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0203  protein of unknown function DUF709  39.24 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.947238  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  49.3 
 
 
371 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4120  hypothetical protein  44.58 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47450  hypothetical protein  39.29 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1389  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4096  hypothetical protein  39.29 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1298  hypothetical protein  44.58 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3906  protein of unknown function DUF709  34.52 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4590  hypothetical protein  44.58 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2530  hypothetical protein  41.98 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1564  hypothetical protein  44.05 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3899  hypothetical protein  44.58 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.999369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3921  hypothetical protein  44.05 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1462  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0238  hypothetical protein  35.53 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000167483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3126  protein of unknown function DUF709  34.67 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.679303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1609  hypothetical protein  38.36 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02884  hypothetical protein  29.73 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1721  hypothetical protein  34.12 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000976518  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0800  hypothetical protein  32.94 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.96088 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0807  hypothetical protein  32.94 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0246131  normal  0.936931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2277  hypothetical protein  30.67 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>