146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0082 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  100 
 
 
350 aa  702  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.243954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.44 
 
 
357 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40 
 
 
399 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.36 
 
 
401 aa  221  1e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  36.49 
 
 
508 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.67 
 
 
357 aa  196  5e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1018  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.37 
 
 
245 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1687  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.46 
 
 
247 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.839125  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.85 
 
 
347 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.14 
 
 
353 aa  190  3e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.43 
 
 
351 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.37 
 
 
347 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2773  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.53 
 
 
260 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2157  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.1 
 
 
253 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.663284  normal  0.0535833 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0479  cobalamin biosynthesis protein  38.98 
 
 
254 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0444  cobalamin biosynthesis protein  38.98 
 
 
254 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.753479  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  33.66 
 
 
561 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3130  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.87 
 
 
249 aa  175  1e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.953869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0074  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.41 
 
 
263 aa  175  1e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  29.71 
 
 
351 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  33.33 
 
 
663 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0703  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.08 
 
 
320 aa  166  7e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.75 
 
 
629 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.81 
 
 
837 aa  165  1e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0314  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.23 
 
 
349 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.04 
 
 
778 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.46 
 
 
610 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.16 
 
 
631 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 
623 aa  156  5e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.02 
 
 
623 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.75 
 
 
800 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  30.12 
 
 
614 aa  152  9e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.33 
 
 
379 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.17 
 
 
368 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.25 
 
 
577 aa  148  1e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.98 
 
 
810 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.27 
 
 
626 aa  146  7e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.31 
 
 
574 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.65 
 
 
598 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.86 
 
 
958 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.85 
 
 
351 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  32.28 
 
 
620 aa  137  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.64 
 
 
611 aa  133  4e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0615  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.5 
 
 
347 aa  133  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000212021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.91 
 
 
354 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.36 
 
 
626 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.32 
 
 
365 aa  132  1e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.73 
 
 
340 aa  132  1e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.03 
 
 
593 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  31.7 
 
 
593 aa  128  1e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1715  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.69 
 
 
351 aa  127  2e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.35 
 
 
350 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  26.98 
 
 
655 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  30.26 
 
 
537 aa  121  2e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.07 
 
 
600 aa  120  4e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  28.48 
 
 
606 aa  120  4e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2363  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.03 
 
 
351 aa  120  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.79543 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2250  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.03 
 
 
351 aa  120  5e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.662898  normal  0.279224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2204  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.03 
 
 
351 aa  120  5e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2150  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.03 
 
 
351 aa  118  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2197  cobalamin biosynthesis protein CbiG  27.75 
 
 
351 aa  118  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.39 
 
 
600 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.42 
 
 
867 aa  117  4e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.49 
 
 
329 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205342  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  31.01 
 
 
579 aa  115  9e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.24 
 
 
425 aa  114  4e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.84 
 
 
246 aa  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.03 
 
 
604 aa  110  4e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1014  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.21 
 
 
332 aa  110  4e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.36 
 
 
332 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.15 
 
 
594 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.05 
 
 
398 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.19 
 
 
290 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2015  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  23.76 
 
 
424 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00297302  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.62 
 
 
612 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.56 
 
 
427 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1235  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.16 
 
 
284 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0291  cobalamin biosynthesis protein CbiG  25.91 
 
 
319 aa  83.2  7e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.08 
 
 
279 aa  83.2  7e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.12 
 
 
290 aa  82  1e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.21 
 
 
276 aa  79  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  44.05 
 
 
258 aa  78.2  2e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.51 
 
 
259 aa  77.4  3e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  21.68 
 
 
824 aa  74.7  2e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  24.75 
 
 
331 aa  72.8  9e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1079  cobalamin biosynthesis protein CbiG  25.5 
 
 
289 aa  71.6  2e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  23.59 
 
 
290 aa  71.6  2e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0036  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  22.56 
 
 
329 aa  70.9  3e-11  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.384647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1079  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  24.62 
 
 
323 aa  69.7  6e-11  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  23.51 
 
 
567 aa  69.7  8e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  21.43 
 
 
601 aa  68.6  2e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  23.61 
 
 
581 aa  67.4  3e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  25.82 
 
 
566 aa  67.8  3e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  22.15 
 
 
567 aa  67.4  4e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  23.61 
 
 
564 aa  67  5e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  21.69 
 
 
574 aa  66.2  8e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1871  cobalamin biosynthesis protein CbiG  25 
 
 
328 aa  66.2  8e-10  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1818  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  22.77 
 
 
323 aa  66.2  8e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1720  cobalamin biosynthesis protein CbiG  23.15 
 
 
290 aa  65.5  1e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3475  cobalamin biosynthesis protein CbiG  23.03 
 
 
335 aa  65.5  1e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>