34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3846 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  48.53 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  48.53 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  49.32 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  49.3 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  45.07 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  44.44 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  43.06 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  45.83 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  42.25 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  42.65 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  43.66 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  44.29 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  44.44 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  39.73 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  40.85 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  40.85 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  48.33 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  44.12 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  39.13 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  48.84 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  35.21 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  33.8 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  40.98 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  34.78 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  41.86 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  35.71 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  43.66 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0110  hypothetical protein  43.1 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  40.43 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2037  hypothetical protein  35.38 
 
 		 83 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>