28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0099 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  84.54 
 
 
194 aa  332  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  70.72 
 
 
183 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  70.06 
 
 
183 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  70.44 
 
 
186 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  69.81 
 
 
186 aa  237  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  68.55 
 
 
187 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  35.47 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  31.18 
 
 
179 aa  73.9  1e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  29.49 
 
 
179 aa  73.6  2e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  68.2  7e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  28.07 
 
 
178 aa  64.7  8e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  32.1 
 
 
184 aa  59.7  3e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  32.1 
 
 
188 aa  59.7  3e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  29.65 
 
 
181 aa  58.2  9e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  29.67 
 
 
173 aa  57.4  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  31.82 
 
 
178 aa  57  2e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  32.08 
 
 
188 aa  56.6  2e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  29.34 
 
 
181 aa  54.3  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  31.35 
 
 
178 aa  53.9  2e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  30.95 
 
 
174 aa  52.8  3e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  31.02 
 
 
193 aa  51.6  8e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  31.02 
 
 
193 aa  51.6  8e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  31.45 
 
 
182 aa  51.2  1e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  29.94 
 
 
168 aa  48.5  6e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  30.29 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  26.11 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  31.87 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>