29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0017 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  751    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  70.65 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  42.71 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  41.06 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  41.32 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  51.45 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  65.1 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  57.51 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  54.95 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  48.86 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  51.35 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  55.87 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  53.65 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  54.19 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  50.44 
 
 		 447 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  51.12 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  50.91 
 
 		 347 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  57.4 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  50.68 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  49.77 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  59.62 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  59.62 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  62.3 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  44.92 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  45.3 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  45.3 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  64.23 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  48.33 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  40.83 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>