More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4781 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  100 
 
 
330 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  71.43 
 
 
318 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  62.89 
 
 
320 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  59.49 
 
 
324 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  67.23 
 
 
254 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  55.18 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  43.03 
 
 
336 aa  309  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  60 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  52.48 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
318 aa  298  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  54.11 
 
 
323 aa  295  9e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  52.68 
 
 
341 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 
337 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  43.07 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 
337 aa  272  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  43.07 
 
 
337 aa  271  9e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
337 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
337 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
337 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
337 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
337 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
337 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
337 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  57.45 
 
 
326 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  44.63 
 
 
336 aa  268  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
334 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
341 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  45.25 
 
 
329 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
341 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  44.44 
 
 
324 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  44.12 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  48.1 
 
 
333 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.04 
 
 
342 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  50 
 
 
331 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  47.57 
 
 
333 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
330 aa  257  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  39.53 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  41.2 
 
 
326 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  36.91 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  41.78 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  46.46 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  43.14 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  41.37 
 
 
336 aa  242  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
339 aa  241  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  43.48 
 
 
325 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  40 
 
 
329 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  40.47 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  42.32 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  39.7 
 
 
330 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  41.8 
 
 
324 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
322 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  44 
 
 
334 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  44.63 
 
 
326 aa  235  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  41.56 
 
 
328 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  54.5 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  43.09 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  41.37 
 
 
331 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  43 
 
 
334 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  54.09 
 
 
292 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
261 aa  230  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  48 
 
 
265 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  42.67 
 
 
334 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  41.47 
 
 
333 aa  228  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  39.92 
 
 
262 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  33.44 
 
 
328 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  51.69 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  39.59 
 
 
332 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  46.33 
 
 
333 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  37.77 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  39.59 
 
 
332 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  41.58 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  34.98 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  43.86 
 
 
324 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  42.81 
 
 
328 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  42.81 
 
 
328 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  42.95 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  42.61 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  42.95 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  33.33 
 
 
329 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  32.61 
 
 
331 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  34.69 
 
 
331 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  40 
 
 
314 aa  202  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
314 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  41 
 
 
302 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 
343 aa  185  8e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  37.14 
 
 
332 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  36.36 
 
 
310 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  35.51 
 
 
250 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.11 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
329 aa  155  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 
411 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.19 
 
 
324 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.32 
 
 
330 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.72 
 
 
324 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  33.92 
 
 
327 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3883  ABC transporter related  40.09 
 
 
321 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.151879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>