31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3143 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  100 
 
 		 471 aa  913    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  59.51 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  51.95 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  53.47 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  51.72 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  46.88 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  42.66 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  43.28 
 
 		 518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  39.59 
 
 		 507 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  41.36 
 
 		 519 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  42.36 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  40.96 
 
 		 517 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  39.01 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  38.19 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  42.35 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  35.2 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  28 
 
 		 164 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  38.33 
 
 		 124 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  31.48 
 
 		 168 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  33.07 
 
 		 168 aa  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  28.12 
 
 		 175 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  30.3 
 
 		 246 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  29.66 
 
 		 177 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  34.48 
 
 		 169 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  29.82 
 
 		 882 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 665 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 665 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  33.09 
 
 		 181 aa  43.5  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>