47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1445 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  100 
 
 		 362 aa  694    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  53.58 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  51.45 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  49.4 
 
 		 335 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  52.38 
 
 		 335 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.09 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  47.66 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.85 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  47.37 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  46.47 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.19 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  45.85 
 
 		 372 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.27 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.77 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.94 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  39.2 
 
 		 376 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.83 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  52.81 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.32 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.13 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  52.4 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.59 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  43.32 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  39.22 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.62 
 
 		 335 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  45.68 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  39.16 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  39.05 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  41.3 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  39.27 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  37.14 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  40.19 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  34.14 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  35.23 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  32.81 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  24.73 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  24.04 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  29.17 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  23.7 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  23.99 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  26.14 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  23.3 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  29.41 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  24.58 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  23.39 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  22.02 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  24.04 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>