34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6059 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  80.23 
 
 
258 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  80.23 
 
 
258 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  80.23 
 
 
258 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  78.99 
 
 
260 aa  390  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  73.54 
 
 
257 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  60.71 
 
 
264 aa  283  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  58.37 
 
 
269 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  55.77 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  57.37 
 
 
266 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  60.24 
 
 
261 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  55.64 
 
 
260 aa  255  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  58.37 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  54.96 
 
 
268 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  55.51 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  50.19 
 
 
269 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  54.98 
 
 
332 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  51.36 
 
 
270 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  51.36 
 
 
270 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  51.36 
 
 
270 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  49.03 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  45.53 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  44.36 
 
 
266 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  45.24 
 
 
284 aa  204  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  48.21 
 
 
270 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  44.62 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  42.8 
 
 
264 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  44.58 
 
 
264 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  40.93 
 
 
269 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  37.05 
 
 
250 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  31.47 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  35.92 
 
 
266 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  31.54 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  29.62 
 
 
265 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>