46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2758 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  90.21 
 
 
144 aa  255  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  78.17 
 
 
144 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  78.17 
 
 
144 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  78.17 
 
 
144 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  74.65 
 
 
144 aa  176  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  51.61 
 
 
141 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  46.04 
 
 
156 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  46.81 
 
 
143 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  46.76 
 
 
167 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  43.57 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  44.85 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  41.48 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  43.8 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  39.16 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  41.43 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  40.15 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  43.45 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.66 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  43.88 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  40.44 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  40.97 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  34.01 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  41.38 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  44.14 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  45.65 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  43.88 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  39.72 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  37.6 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.66 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  30.67 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  41.57 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  46.59 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  31.43 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  43.38 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  32.17 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  41.56 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  31.88 
 
 
458 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  25.53 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  36.03 
 
 
158 aa  43.5  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  30.92 
 
 
455 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  27.46 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4951  protein of unknown function DUF107  38.67 
 
 
157 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125072  normal  0.546371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>