248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0021 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
344 aa  689    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  74.71 
 
 
344 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  52.55 
 
 
344 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  54.03 
 
 
345 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  53.59 
 
 
359 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  53.59 
 
 
359 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  53.01 
 
 
342 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  54.66 
 
 
358 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
340 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4221  flagellar motor switch protein G  35.38 
 
 
351 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  31.93 
 
 
362 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  30.58 
 
 
362 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  31.5 
 
 
362 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  33.03 
 
 
339 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  31.33 
 
 
362 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  31.8 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  31.02 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  30.06 
 
 
363 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  30.12 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  31.44 
 
 
350 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0247  flagellar motor switch protein G  34.6 
 
 
345 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0377031  normal  0.550759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  29.48 
 
 
339 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0722  flagellar motor switch protein G  31.38 
 
 
347 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0113  flagellar motor switch protein G  34.34 
 
 
351 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.150638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0342  flagellar motor switch protein G  31.78 
 
 
346 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320445  normal  0.0115185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0310  flagellar motor switch protein G  31.46 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  31.8 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0306  flagellar motor switch protein G  33.13 
 
 
335 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1152  flagellar motor switch protein G  32.52 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  28.62 
 
 
351 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  29.66 
 
 
350 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  27.49 
 
 
352 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  29.71 
 
 
350 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  28.62 
 
 
351 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  28.62 
 
 
351 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  28.21 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  28.21 
 
 
335 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  28.75 
 
 
338 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  27.25 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  28.62 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  28.61 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  27.81 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  28.14 
 
 
336 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  26.2 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  25.23 
 
 
330 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  25.99 
 
 
340 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  26.48 
 
 
337 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  28.43 
 
 
338 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  27.55 
 
 
338 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  25.53 
 
 
333 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  27.52 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  27.5 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  28.25 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1669  flagellar motor switch protein G  25.31 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  25.62 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  25.47 
 
 
336 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  27.81 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1357  flagellar motor switch protein G  26.15 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  25.3 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  24.78 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  24.78 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  25.97 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0364  flagellar motor switch protein G  26.49 
 
 
342 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  24.21 
 
 
335 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0341  flagellar motor switch protein G  26.49 
 
 
342 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  26.15 
 
 
336 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1660  flagellar motor switch protein FliG  24.16 
 
 
340 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  26.15 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  25.91 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1644  flagellar motor switch protein G  26.49 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.255846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  26.79 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  23.55 
 
 
334 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1592  flagellar motor switch protein G  24.29 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  25.53 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  24.84 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  25.7 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0473  flagellar motor switch protein G  24.22 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  24.85 
 
 
349 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  22.88 
 
 
335 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  24.62 
 
 
338 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  24.84 
 
 
339 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  25.53 
 
 
344 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  25.07 
 
 
338 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0266  flagellar motor switch protein G  25.23 
 
 
342 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  25.38 
 
 
339 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  23.77 
 
 
343 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0219  flagellar motor switch protein FliG  26.15 
 
 
341 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  26.15 
 
 
336 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  23.82 
 
 
342 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  23.88 
 
 
334 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  23.93 
 
 
346 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  24.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  24.61 
 
 
360 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  26.51 
 
 
335 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0648  flagellar motor switch protein FliG  25.91 
 
 
332 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0245668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  24.31 
 
 
348 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  24.31 
 
 
348 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  23.56 
 
 
351 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1441  flagellar motor switch protein FliG  25.15 
 
 
339 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  28.53 
 
 
330 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>