More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2838 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 356 aa  735    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  40.96 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  39.05 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  37.97 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  37.7 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  37.43 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  38.11 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  38.11 
 
 		 395 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  38.11 
 
 		 395 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  38.11 
 
 		 527 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  40.59 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  41.07 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  41.48 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  38.44 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  37.82 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  38.54 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  40.43 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  37.7 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  40.37 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  40.05 
 
 		 406 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  37.13 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  39.95 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  40.63 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  39.69 
 
 		 415 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  40.63 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  40.25 
 
 		 376 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  40.16 
 
 		 406 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  38.42 
 
 		 403 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  38.36 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  38.36 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.41 
 
 		 400 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.41 
 
 		 400 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  39.94 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  39.08 
 
 		 407 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  41.42 
 
 		 406 aa  225  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  38.77 
 
 		 401 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  39.08 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  42.53 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  39.15 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  36.7 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  39.1 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  38.77 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  37.99 
 
 		 400 aa  222  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  39.1 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  39.25 
 
 		 406 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  40.21 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  38.22 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  37.87 
 
 		 407 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  42.3 
 
 		 407 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  38.13 
 
 		 540 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  38.71 
 
 		 410 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  36.94 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  36.94 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.1 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  36.94 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  39.29 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.44 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  38.77 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  37.53 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  38.48 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  40.51 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  35.86 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  36.8 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  36.63 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.01 
 
 		 519 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  37.63 
 
 		 416 aa  212  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  40.89 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.79 
 
 		 446 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  41.61 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  41.61 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  36.93 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.79 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  36.48 
 
 		 401 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  40.39 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.79 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  35.79 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  37.04 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  35.79 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.79 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  39.49 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  40.89 
 
 		 435 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  36.36 
 
 		 402 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  41.42 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  35.46 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  38.75 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  38.75 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  37.88 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  38.75 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  35.46 
 
 		 436 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  37.83 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  38.7 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  40.27 
 
 		 441 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  38.12 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  35.71 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  34.84 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>