More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6504 on replicon NC_010504
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
215 aa  400  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.67 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.96 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.49 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.46 
 
 
238 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.56 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  35.14 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.86 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.86 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.81 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.52 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.77 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  27.05 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.07 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  27.32 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  26.47 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.65 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.21 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  26.09 
 
 
348 aa  65.1  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  38.16 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 
253 aa  64.3  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  34.59 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.66 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.21 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.87 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  31.44 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.13 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.13 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  26.82 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 
217 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.93 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 
259 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  26.9 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  29.9 
 
 
256 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.9 
 
 
256 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
352 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  34.01 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  26.1 
 
 
270 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  26.74 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.99 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  28.92 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  30.56 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  27.16 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  29.31 
 
 
265 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  30.51 
 
 
327 aa  59.3  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  27.78 
 
 
276 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.37 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
264 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  28.16 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.78 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  27.31 
 
 
323 aa  58.9  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.41 
 
 
253 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  27.41 
 
 
253 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  27.41 
 
 
253 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.41 
 
 
253 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.41 
 
 
253 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.41 
 
 
253 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>