126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5862 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
158 aa  311  3e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  77.24 
 
 
157 aa  235  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  76.55 
 
 
158 aa  219  1e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  76.55 
 
 
158 aa  219  1e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.86 
 
 
152 aa  172  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.32 
 
 
148 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.82 
 
 
216 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  53.9 
 
 
148 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.79 
 
 
156 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.48 
 
 
148 aa  153  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 
154 aa  153  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.78 
 
 
213 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.11 
 
 
151 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.41 
 
 
154 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.11 
 
 
153 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.11 
 
 
147 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
154 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.98 
 
 
155 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  48.43 
 
 
213 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.77 
 
 
151 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.16 
 
 
246 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 
202 aa  139  2e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  47.17 
 
 
161 aa  139  2e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.07 
 
 
151 aa  139  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.53 
 
 
197 aa  137  8e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.67 
 
 
155 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.34 
 
 
224 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.34 
 
 
224 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  48.65 
 
 
232 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.79 
 
 
204 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  43.97 
 
 
150 aa  132  1e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  43.97 
 
 
150 aa  133  1e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.44 
 
 
198 aa  133  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.62 
 
 
208 aa  133  1e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.39 
 
 
187 aa  132  2e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.47 
 
 
243 aa  128  2e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.23 
 
 
151 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.61 
 
 
152 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.22 
 
 
182 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.88 
 
 
193 aa  125  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.37 
 
 
178 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.2 
 
 
176 aa  118  4e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  47.2 
 
 
176 aa  117  5e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 
241 aa  116  1e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.41 
 
 
269 aa  116  1e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.11 
 
 
249 aa  110  8e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  47.52 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.83 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.05 
 
 
983 aa  84.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  33.33 
 
 
997 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  34.04 
 
 
1012 aa  83.2  1e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.66 
 
 
152 aa  82  3e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.61 
 
 
1011 aa  82  3e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.61 
 
 
1011 aa  82  3e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.48 
 
 
220 aa  79.7  1e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.41 
 
 
987 aa  79.7  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  34.25 
 
 
980 aa  77.8  5e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.88 
 
 
1012 aa  76.6  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.58 
 
 
229 aa  74.7  5e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.83 
 
 
1019 aa  74.3  7e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 
149 aa  73.2  1e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.11 
 
 
153 aa  73.2  1e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  36.23 
 
 
221 aa  72.8  2e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  37.67 
 
 
991 aa  72  3e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.16 
 
 
204 aa  72  3e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.52 
 
 
988 aa  71.6  4e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.94 
 
 
154 aa  71.2  5e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.97 
 
 
222 aa  70.9  8e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 
185 aa  67.8  6e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2028  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  61.7 
 
 
56 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.18 
 
 
150 aa  65.5  3e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.93 
 
 
208 aa  63.9  9e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.79 
 
 
254 aa  62.8  2e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.31 
 
 
223 aa  62.4  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  32.58 
 
 
988 aa  62  4e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.15 
 
 
206 aa  60.1  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.41 
 
 
148 aa  60.1  1e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  25.32 
 
 
1027 aa  59.3  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  30.77 
 
 
241 aa  58.9  3e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.95 
 
 
237 aa  57.8  5e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  29.73 
 
 
289 aa  57.8  6e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 
295 aa  57  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  26.62 
 
 
253 aa  56.6  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 
237 aa  56.2  2e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 
216 aa  55.5  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.97 
 
 
253 aa  55.1  3e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.74 
 
 
141 aa  54.7  5e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  30.67 
 
 
262 aa  54.3  6e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  26.51 
 
 
200 aa  54.7  6e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.39 
 
 
251 aa  54.3  7e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
222 aa  53.5  1e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
222 aa  53.5  1e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
248 aa  53.5  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
222 aa  53.5  1e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 
147 aa  52  4e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
390 aa  51.2  6e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.61 
 
 
234 aa  50.1  1e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.83 
 
 
306 aa  50.1  1e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.47 
 
 
242 aa  49.7  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>