More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1003 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
232 aa  480  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.81 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  42.79 
 
 
232 aa  208  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.36 
 
 
669 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  37.93 
 
 
625 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  35.06 
 
 
597 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.06 
 
 
702 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  35.06 
 
 
670 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.47 
 
 
585 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  35.59 
 
 
627 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.23 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  34.47 
 
 
585 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.32 
 
 
688 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.48 
 
 
375 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.63 
 
 
677 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.16 
 
 
361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.65 
 
 
384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1104  hypothetical protein  30.1 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241757  normal  0.525247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  33.76 
 
 
365 aa  118  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  30.39 
 
 
662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  31.03 
 
 
605 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  31.9 
 
 
379 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 
396 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.58 
 
 
381 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  30.3 
 
 
368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.58 
 
 
375 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31 
 
 
363 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  29.06 
 
 
605 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.67 
 
 
397 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.98 
 
 
412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.25 
 
 
447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.26 
 
 
380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.48 
 
 
382 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.14 
 
 
383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  30 
 
 
366 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.17 
 
 
374 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.39 
 
 
376 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  30 
 
 
366 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  32.49 
 
 
606 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  32.49 
 
 
606 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.26 
 
 
380 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.7 
 
 
371 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.54 
 
 
465 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.05 
 
 
380 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.05 
 
 
380 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.13 
 
 
375 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.05 
 
 
380 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.05 
 
 
358 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.05 
 
 
380 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.05 
 
 
381 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  32.05 
 
 
381 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.05 
 
 
380 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.7 
 
 
367 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.86 
 
 
358 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.8 
 
 
407 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  29.11 
 
 
356 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.62 
 
 
382 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.54 
 
 
367 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  32.05 
 
 
382 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.09 
 
 
356 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0569  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.24 
 
 
281 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.62 
 
 
382 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29 
 
 
354 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  30.04 
 
 
366 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.62 
 
 
382 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.62 
 
 
382 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  30.04 
 
 
366 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3530  hydrogenase, putative  30.17 
 
 
279 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  30.3 
 
 
339 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  30.3 
 
 
339 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  30.3 
 
 
339 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.04 
 
 
366 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1213  hydrogenase, putative  32.56 
 
 
280 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.693277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.99 
 
 
362 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.2 
 
 
382 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.2 
 
 
382 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 
261 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.58 
 
 
445 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.88 
 
 
360 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.94 
 
 
348 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.04 
 
 
390 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.83 
 
 
389 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  29.49 
 
 
581 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.62 
 
 
385 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  30.34 
 
 
418 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.22 
 
 
388 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  29.39 
 
 
394 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.77 
 
 
414 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.48 
 
 
331 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  28.7 
 
 
358 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  32.7 
 
 
510 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.26 
 
 
356 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.25 
 
 
390 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.33 
 
 
362 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.2 
 
 
387 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.93 
 
 
351 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  28.81 
 
 
350 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  29.24 
 
 
381 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  31.07 
 
 
395 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.61 
 
 
368 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>