233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2241 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  78.41 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  76.14 
 
 
91 aa  140  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  62.79 
 
 
92 aa  120  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  63.22 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  60.47 
 
 
92 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  63.95 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  58.89 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  60.47 
 
 
97 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  57.47 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  58.14 
 
 
97 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  59.09 
 
 
93 aa  106  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  53.49 
 
 
92 aa  104  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  55.81 
 
 
89 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  57.47 
 
 
93 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  56.41 
 
 
96 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  55.17 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  54.65 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  52.87 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  50.79 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  46.03 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  38.37 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  33.75 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  48.39 
 
 
85 aa  60.5  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  40.26 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  43.55 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  33.75 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  33.75 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  34.88 
 
 
89 aa  57.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  49.09 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  35.21 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  29.89 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  38.57 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  40.28 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  39.34 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  38.24 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  37.66 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  45.16 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  41.27 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  41.27 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  30.86 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  30.86 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  35.8 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  36.99 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  49.09 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  36.11 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  37.7 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  43.64 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  36.11 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  43.64 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  43.86 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  36.11 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  47.27 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  36.11 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  36.11 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  39.68 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  44.44 
 
 
89 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  35.06 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  35.06 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  37.7 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  34.72 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  39.68 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  45.28 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  35.06 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  36.62 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  36.62 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  36.07 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  40.62 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  41.82 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  41.82 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  35.06 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  41.82 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  36.07 
 
 
91 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  34.43 
 
 
91 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  30 
 
 
101 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  32.88 
 
 
93 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  36.62 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  36.62 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  35.62 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  31.4 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  32.05 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>