289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3987 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  100 
 
 
431 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  86.75 
 
 
432 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  100 
 
 
417 aa  814    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  100 
 
 
431 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  85.99 
 
 
431 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  75.12 
 
 
435 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  70.54 
 
 
438 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  64.18 
 
 
416 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  64.93 
 
 
427 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  57.82 
 
 
431 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  55.2 
 
 
412 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  54.46 
 
 
447 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  51.61 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  51.72 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  56.97 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  53.66 
 
 
445 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  51.94 
 
 
427 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  50.98 
 
 
426 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  50.12 
 
 
428 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  51.47 
 
 
454 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  49.88 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  52.42 
 
 
435 aa  355  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  48.65 
 
 
431 aa  353  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  47.9 
 
 
427 aa  352  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  49.63 
 
 
440 aa  349  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  46.42 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  52.22 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  51.17 
 
 
430 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  46.44 
 
 
422 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  49.13 
 
 
430 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  47.79 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  44.92 
 
 
453 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  30.32 
 
 
426 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  32.08 
 
 
421 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  29.56 
 
 
430 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  30.34 
 
 
625 aa  130  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  28.5 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  36.61 
 
 
452 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  26.02 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  28.92 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  30.94 
 
 
413 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  26.37 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.67 
 
 
453 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  30.19 
 
 
430 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  32.6 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  31.35 
 
 
451 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 
425 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
446 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  30.29 
 
 
444 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  33.03 
 
 
450 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.02 
 
 
446 aa  106  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  33.94 
 
 
452 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
418 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  28.51 
 
 
542 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  28.63 
 
 
442 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  30.3 
 
 
460 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  23.36 
 
 
423 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  23.36 
 
 
423 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  29.91 
 
 
463 aa  99.8  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  29.06 
 
 
449 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  28.98 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  30.43 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  30.43 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  30.09 
 
 
462 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28.28 
 
 
458 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  30.77 
 
 
454 aa  97.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  29.08 
 
 
450 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  30.09 
 
 
462 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  30.97 
 
 
452 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  30 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  30.64 
 
 
465 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  30.36 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  30.64 
 
 
465 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  28.22 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  26.72 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  26.72 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  24.75 
 
 
425 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  29.52 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  30.84 
 
 
463 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  29.6 
 
 
447 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  31.47 
 
 
454 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  30.32 
 
 
454 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  31.25 
 
 
472 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  30.32 
 
 
454 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  27.8 
 
 
458 aa  92.8  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  30.32 
 
 
454 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  23.97 
 
 
449 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  30.32 
 
 
454 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  31.28 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  28.84 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  29.33 
 
 
455 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  29.49 
 
 
454 aa  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  30.84 
 
 
454 aa  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  29.18 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  26.97 
 
 
454 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  29.96 
 
 
449 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  25.38 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  31.73 
 
 
473 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  28.94 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  27.63 
 
 
454 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>