More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0092 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  100 
 
 
425 aa  857    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  52 
 
 
425 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  53.37 
 
 
425 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  30.36 
 
 
426 aa  196  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  31.46 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  27.6 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  28.91 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  26.28 
 
 
430 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  27.95 
 
 
459 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  29.88 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  28.88 
 
 
625 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
423 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 
423 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  30.12 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4583  CBS  25.82 
 
 
419 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  30.53 
 
 
542 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  26.56 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.38 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  31.42 
 
 
452 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  29.33 
 
 
442 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  25.94 
 
 
427 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  28.24 
 
 
431 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  28.51 
 
 
463 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  25.99 
 
 
435 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  29.86 
 
 
454 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  25.06 
 
 
424 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  27.19 
 
 
471 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  24.82 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  28.51 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  29.33 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  24.58 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  30.25 
 
 
449 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  28.14 
 
 
450 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  27.16 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  29.28 
 
 
494 aa  96.3  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  26.84 
 
 
446 aa  96.3  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  27.03 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
446 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  24.88 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  30.49 
 
 
430 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  24.41 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  26.69 
 
 
462 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  24.41 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  26.37 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  26.69 
 
 
462 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  24.75 
 
 
417 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  29.39 
 
 
480 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  23.69 
 
 
427 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  26.42 
 
 
453 aa  93.6  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  29.39 
 
 
480 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  27.23 
 
 
444 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  25.71 
 
 
440 aa  93.2  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  28.95 
 
 
480 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  28.51 
 
 
480 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  27.83 
 
 
461 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  25.65 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  24.36 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  29.07 
 
 
454 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  25.96 
 
 
454 aa  91.3  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  25.39 
 
 
428 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  24.38 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  27.02 
 
 
474 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  26.32 
 
 
473 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  24.8 
 
 
427 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  28.05 
 
 
430 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  28.88 
 
 
479 aa  89.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  27.27 
 
 
463 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  27.19 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  25.86 
 
 
449 aa  89.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  24.88 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  28.45 
 
 
480 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  27.19 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  23.39 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  25.68 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  25.11 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  31.79 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  27.63 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  27.51 
 
 
480 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  27.63 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  27.78 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  25.91 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  24.64 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  24.79 
 
 
458 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  30.59 
 
 
467 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  25.3 
 
 
413 aa  87.4  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  23.25 
 
 
449 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  25.81 
 
 
478 aa  87  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  24.39 
 
 
454 aa  86.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  28.07 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  25.53 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  25.76 
 
 
486 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  26.55 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  26.18 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  26.24 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  23.25 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  23.7 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  23.44 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  28.07 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  24.89 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  24.63 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>