51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1860 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  800    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  99.73 
 
 		 369 aa  716    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  800    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  70.35 
 
 		 372 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  70.5 
 
 		 381 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  65.17 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  57.91 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  51.99 
 
 		 399 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  56.76 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  50.39 
 
 		 382 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  47.82 
 
 		 416 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  41.91 
 
 		 388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  36.62 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  39.19 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  32.99 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  39.24 
 
 		 400 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  32.91 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  36.34 
 
 		 428 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  38.04 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  35.26 
 
 		 407 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  35.24 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  36.04 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  36.46 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  31.73 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  37.64 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  34.78 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  34.82 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  36.34 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  34.88 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  34.1 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  33.92 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  30 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.3 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  36.36 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  33.58 
 
 		 443 aa  93.6  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  26.07 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  26.1 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25.41 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  32.88 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  30.45 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  30.15 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  25.68 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.21 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.71 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  20.23 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  20.98 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  20.99 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  22.19 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  27.66 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  24 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>