27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0167 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  100 
 
 
127 aa  243  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  100 
 
 
127 aa  243  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  99.21 
 
 
127 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  70.69 
 
 
129 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  66.67 
 
 
148 aa  156  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  68.22 
 
 
123 aa  134  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  58.04 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  46.49 
 
 
138 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  49.57 
 
 
118 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  48.62 
 
 
127 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  54.17 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  42.74 
 
 
137 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  45.22 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  48.39 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  46.88 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  45.19 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  53.61 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  37.82 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  42.06 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  44.55 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  49.32 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  37.01 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  36.07 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  42.27 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0051  hypothetical protein  28.91 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  34.21 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>