239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1860 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.71 
 
 
243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.69 
 
 
241 aa  308  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.69 
 
 
241 aa  308  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.87 
 
 
243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  64.71 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.13 
 
 
243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.29 
 
 
243 aa  304  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.29 
 
 
243 aa  304  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.29 
 
 
243 aa  304  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.29 
 
 
243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.29 
 
 
243 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  63.87 
 
 
243 aa  299  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.76 
 
 
245 aa  294  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.5 
 
 
246 aa  292  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.53 
 
 
270 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.55 
 
 
261 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  61.6 
 
 
250 aa  286  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  286  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.08 
 
 
243 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.23 
 
 
246 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.24 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.59 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.76 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.59 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.92 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.24 
 
 
248 aa  281  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 
248 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.33 
 
 
243 aa  279  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.16 
 
 
265 aa  278  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.72 
 
 
248 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.56 
 
 
243 aa  276  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.15 
 
 
248 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0031  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.71 
 
 
244 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.82 
 
 
246 aa  275  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.08 
 
 
247 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  57.5 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.15 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.8 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.8 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.08 
 
 
246 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.26 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 
245 aa  271  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
242 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.02 
 
 
240 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.02 
 
 
246 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
242 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
242 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 
245 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.02 
 
 
246 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.92 
 
 
240 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.08 
 
 
245 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.56 
 
 
247 aa  268  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.78 
 
 
242 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.6 
 
 
246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 
245 aa  268  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.54 
 
 
239 aa  267  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 
245 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 
245 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 
245 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.3 
 
 
248 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 
245 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.12 
 
 
248 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1002  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.05 
 
 
239 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2927  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.5 
 
 
245 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.66 
 
 
265 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11981  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.66 
 
 
238 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.526754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.08 
 
 
323 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.08 
 
 
238 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2845  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.08 
 
 
245 aa  261  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.76 
 
 
235 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.24 
 
 
244 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.76 
 
 
235 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.66 
 
 
238 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1151  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.5 
 
 
245 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.05 
 
 
260 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3023  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.34 
 
 
245 aa  259  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.316333  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.08 
 
 
245 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.84 
 
 
240 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.9 
 
 
244 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.78 
 
 
247 aa  256  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.05 
 
 
250 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.9 
 
 
246 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.36 
 
 
254 aa  254  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.07 
 
 
239 aa  254  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>