34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5483 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  80.23 
 
 		 258 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  75.88 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  73.54 
 
 		 257 aa  362  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  62.79 
 
 		 264 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  58.08 
 
 		 271 aa  278  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  59.14 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  55.78 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  59.84 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  61.35 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  56.25 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  57.59 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  56.58 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  53.88 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  53.88 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  53.88 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  49.81 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  55.56 
 
 		 332 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  50.97 
 
 		 270 aa  228  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  46.43 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  45.82 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  43.58 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  43.97 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  48.25 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  44.62 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  43.19 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  39.37 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  40.78 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  32.54 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  30.92 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  30.62 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>