35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5050 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5052  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes-like  96.06 
 
 
790 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46089  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  100 
 
 
1213 aa  2452    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  68.77 
 
 
1299 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4667  hypothetical protein  64.81 
 
 
460 aa  526  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2527  hypothetical protein  33.24 
 
 
484 aa  171  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  31.5 
 
 
440 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  29.95 
 
 
428 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  29.95 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  27.47 
 
 
361 aa  67.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  28.64 
 
 
423 aa  67.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  29.63 
 
 
380 aa  58.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  39.22 
 
 
112 aa  57  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  26 
 
 
400 aa  56.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  26.27 
 
 
348 aa  55.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  27.88 
 
 
412 aa  55.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  28.12 
 
 
389 aa  55.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  43.08 
 
 
96 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  43.08 
 
 
96 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  34.62 
 
 
94 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  41.67 
 
 
94 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3426  hypothetical protein  31.48 
 
 
659 aa  48.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00987946  normal  0.0149918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  35.71 
 
 
94 aa  47.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  28.66 
 
 
391 aa  48.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  36.84 
 
 
92 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  36.49 
 
 
100 aa  47.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  39.73 
 
 
97 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  37.18 
 
 
87 aa  46.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1207  putative hexapeptide transferase family protein  26.39 
 
 
370 aa  45.8  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  36 
 
 
93 aa  45.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  40.62 
 
 
99 aa  45.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  30.33 
 
 
267 aa  45.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  41.18 
 
 
95 aa  45.1  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  34.15 
 
 
91 aa  45.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.71 
 
 
764 aa  44.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  37.14 
 
 
98 aa  44.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>