21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3013 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  34.69 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  31.77 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  29.73 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  29.02 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  33 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  30.99 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  29.95 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  30.73 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  30.16 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  31.13 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  30.46 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  29 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  29.8 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  29.26 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  27.31 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  27.64 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  29.29 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  25.37 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  30.6 
 
 		 563 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1213 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>