30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0241 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  65.13 
 
 
260 aa  329  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  30.26 
 
 
300 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  28.28 
 
 
303 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  30 
 
 
301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  29.6 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  28.72 
 
 
286 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  37.09 
 
 
281 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  32.01 
 
 
345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  30.48 
 
 
282 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  25.09 
 
 
295 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  30.69 
 
 
343 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  28.01 
 
 
289 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  32.03 
 
 
338 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  25.98 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  27.51 
 
 
284 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  27.47 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  33 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  23.67 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  20.7 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2658  hypothetical protein  31.76 
 
 
259 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1407  hypothetical protein  31.76 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2571  hypothetical protein  31.76 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2518  hypothetical protein  31.76 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3181  hypothetical protein  31.76 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2133  hypothetical protein  31.76 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  34.53 
 
 
563 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1960  hypothetical protein  31.08 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  27.5 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>